伊金霍洛为蒙古语,圣主陵园之意,以境内有著名的成吉思汗陵园而得名。
汉时分属西河、朔方郡。唐时分属榆林等郡。元置西夏中兴等路,后属东胜、云内二州。清顺治年间设鄂尔多斯左翼中旗(郡王旗)。乾隆年间从鄂尔多斯六旗各析一部设右翼前末旗(札萨克旗)。1958年两旗合并为伊金霍洛旗。
1958年11月5日经国务院82次会议批准,札萨克(公元1736年清高宗从乌审旗将近族台吉的平民分为十三个苏木,划拨土地,组成鄂尔多斯右翼前末旗,即札萨克旗)、郡王(公元1649年清为便于控制蒙古各部落,在鄂尔多斯地区实行盟旗建制,其中之一为鄂尔多斯左翼中旗,即郡王旗)两旗合并,暂称“札郡旗”。1959年1月15日,经内蒙古自治区人民政府批准,取旗名“伊金霍洛旗”。旗址驻地设在新街镇,1964年7月1日迁往阿勒腾席热镇。(以上摘自“伊金霍洛旗政府网站”)
2000年,伊金霍洛旗辖7个镇、3个苏木、6个乡。根据第五次人口普查数据:全旗总人口147739人,其中各乡镇苏木人口(人): 阿勒腾席热镇 29440 新街镇 9345 乌兰木伦镇 24722 纳林陶亥镇 5794 台吉召镇 6990 纳林希里镇 11938 红庆河镇 9016 台格苏木 8331 苏布尔嘎苏木4981 伊金霍洛苏木4622 新庙乡7321 哈巴格希乡5255 合同庙乡3832 公尼召乡7307 布连乡5564 布尔台格乡3281